Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ABCF2Q9UG63 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms