Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPG2Q9UBF2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms