Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNTN3Q9P232 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms