Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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