Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GDE1Q9NZC3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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