Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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