Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM248Q9NWD8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM248Q9NWD8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms