Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CYLDQ9NQC7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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