Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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