Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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