Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM4Q9C037 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms