Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5DQ9BY66 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms