Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SSBP4Q9BWG4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms