Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTKNQ9BST9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms