Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FYCO1Q9BQS8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FYCO1Q9BQS8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms