Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPRD1AQ96P16 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms