Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COG3Q96JB2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COG3Q96JB2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms