Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BORCS6Q96GS4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms