Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC97Q96F63 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms