Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MVB12AQ96EY5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MVB12AQ96EY5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms