Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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