Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NXNL1Q96CM4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms