Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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