Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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TMIEQ8NEW7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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