Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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