Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ZNF248Q8NDW4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF248Q8NDW4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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