Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC50Q8IVM0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms