Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00523Q86TU6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms