Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms