Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTF1AQ7RTS3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms