Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms