Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSTM1Q6UX27 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.7 ms