Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSSK4Q6SA08 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms