Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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