Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms