Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LGSNQ5TDP6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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