Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
COL5A1-AS1Q5SY13 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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