Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
C10orf55Q5SWW7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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