Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LDLRAP1Q5SW96 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms