Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PHYHD1Q5SRE7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms