Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TDRD12Q587J7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms