Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
KLHL12Q53G59 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL12Q53G59 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms