Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC153Q494R4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms