Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 RPL14P3-201ENST00000476715 622 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PHBP8-201ENST00000493810 725 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC15-216ENST00000545680 872 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 IGKV2D-28-202ENST00000558026 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC010551.1-201ENST00000568458 469 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC020728.1-201ENST00000605749 1216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC090950.2-201ENST00000624280 660 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 KIR2DL4-201ENST00000345540 1447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KRTAP20-1Q3LI63 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms