Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHKAPQ2M3C7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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