Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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