Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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DDB1Q16531 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DDB1Q16531 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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