Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDCD2Q16342 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PDCD2Q16342 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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