Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F4Q16254 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms