Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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